荧光定量PCR技术优势
l 灵敏度高,可以检测低拷贝的目的基因;
l 高精度,PCR扩增阶段包括3个阶段:指数增长期,线性增长期和平台期,96个重复指数增长期表现出高精度,而平台期则变化差异较大;
l 定量能力强,简单的流程就能得到高质量的定量数据;
l 动力学范围宽,可以精确定量9个数量级的差异;
l 速度快,节省时间和劳力,不需要电泳检测;
l 安全,使用荧光染料发光,不用EB或放射性物质,极大降低对实验人员健康的威胁;
l 重复性好。
服务内容 核酸提取和反转录
根据客户要求提取动物、植物、细胞和细*等样品DNA或RNA
对所提RNA进行反转录以用于荧光定量PCR反应;
合成
设计合成各种引物并可根据客户要求负责引物的调试;
针对不同引物构建标准品用于绝对定量或相对定量实验;
设计合成各种标记探针并可根据客户要求负责探针的调试。
检测
l mRNA表达检测
l MicroRNA表达和靶基因表达检测
l SNP检测
l 基因copy数检测
l 病原微生物样品检测
研发
接受采用荧光定量PCR的检测方法针对各种检测目标的合作研发和委托研发。
检测方法
固德生物提供两种PCR检测方法服务:SYBR Green I染料法和TaqMan/MGB探针法。
一、染料法:SYBR Green Ⅰ
游离状态下的SYBR Green分子发出微弱的荧光信号,当与dsDNA双螺旋小沟区域结合时,则发出绿色荧光,可在520nm波长下检测荧光信号,荧光信号的强度与dsDNA数量呈正相关。
SYBR Green Ⅰ染料法的特点:
高灵敏度,低背景信号,操作简单,不影响酶促反应,价格便宜。
二、探针法:TaqMan荧光探针/ MGB探针
TaqMan 荧光探针是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5`末端,一般用FAM、VIC、HEX、Cy3、Cy5等荧光基团,而淬灭剂则在3`末端,一般为TAMRA、BHQ1、BHQ2等,其中TAMRA发出黄色荧光,BHQ1和BHQ2不发出荧光。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
TaqMan-MGB探针与普通TaqMan荧光探针相比具有更短的序列和更高的序列特异性,常被用于SNP分型的研究中,有望成为基因诊断和个体化用药分析的首选技术平台。
探针法的特点:
与染料法相比具有更低的背景信号,更高的灵敏度,可以检测低于10个分子的模板,更高的特异性,结果也更准确。同时也具有染料法的操作简单,不影响酶促反应等优点。
服务流程
PCR引物和探针设计合成及调试→标准品制作→样本核酸抽提→反转录→荧光定量PCR扩增检测→数据汇总和初步分析
客户需要提供信息
详细的实验要求,基因名称(提供Gene ID),待测样本(清晰样品编号),保证样本质量。
送样要求
细胞(≥105个);基因组DNA(≥5ug)
检测周期
常规检测任务2-3周内完成,具体时间根据要检测的基因和样本数而定。
报告内容
提供电泳图片、荧光扩增曲线、标准曲线、熔解曲线、原始数据、实验报告等。
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